Studi In Silico Senyawa Daun Sambung Nyawa (Gynura procumbens (Lour.) Merr.) terhadap HER2 dan EGFR sebagai Antikanker Payudara
In Silico Study of (Gynura procumbens (Lour.) Merr.) Compounds Against HER2 and EGFR as Breast Anticancer
DOI:
https://doi.org/10.30737/jafi.v7i2.7723Keywords:
antikanker payudara , Daun Sambung Nyawa , Gynura procumbens (Lour.) Merr, dinamika molekuler , ADMET, HER2, EGFRAbstract
Kanker payudara adalah neoplasma ganas dengan karakteristik biologis yang beragam sehingga mmerlukan terapi spesifik. Pendekatan komputasi, seperti penambatan molekuler, simulasi dinamika molekuler, dan prediksi ADMET, banyak digunakan untuk mengidentifikasi kandidat obat antikanker secara efisien. Studi ini bertujuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif potensial dari Daun Sambung Nyawa (Gynura procumbens (Lour.) Merr.) terhadap protein target HER2 dan EGFR sebagai kandidat obat kanker payudara. Penambatan molekuler dilakukan menggunakan AutoDock 4.0. Senyawa dengan energi terendah kemudian dianalisis melalui simulasi dinamika molekuler menggunakan YASARA dan sifat farmakokinetik dan toksisitasnya diprediksi berdasarkan parameter ADMET. Hasil menunjukkan bahwa beberapa senyawa memiliki afinitas pengikatan yang baik terhadap HER2 dan EGFR dan membentuk kompleks yang stabil berdasarkan nilai RMSD dan RMSF. Prediksi ADMET menunjukkan profil yang mendukung pengembangan lebih lanjut sebagai kandidat obat kanker payudara oral.
References
[1] H. Sung et al., “Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries,” CA Cancer J. Clin., vol. 71, no. 3, pp. 209–249, May 2021, doi: 10.3322/caac.21660.
[2] S. F. Azzahra, E. Harnelly, M. Subianto, W. A. Kusuma, and W. Sari, “Identification and Analysis of Potential Breast Anticancer Agents in Pogostemon Cablin through Network Pharmacology,” Jurnal Penelitian Pendidikan IPA, vol. 10, no. SpecialIssue, pp. 107–119, Aug. 2024, doi: 10.29303/jppipa.v10ispecialissue.7049.
[3] R. L. Siegel, K. D. Miller, H. E. Fuchs, and A. Jemal, “Cancer statistics, 2022,” CA Cancer J. Clin., vol. 72, no. 1, pp. 7–33, Jan. 2022, doi: 10.3322/caac.21708.
[4] C. E. DeSantis et al., “Breast cancer statistics, 2019,” CA Cancer J. Clin., vol. 69, no. 6, pp. 438–451, Nov. 2019, doi: 10.3322/caac.21583.
[5] R. K. Murthy et al., “Tucatinib, Trastuzumab, and Capecitabine for HER2-Positive Metastatic Breast Cancer,” New England Journal of Medicine, vol. 382, no. 7, pp. 597–609, Feb. 2020, doi: 10.1056/nejmoa1914609.
[6] H. L. Tan, K. G. Chan, P. Pusparajah, L. H. Lee, and B. H. Goh, “Gynura procumbens: An overview of the biological activities,” Mar. 15, 2016, Frontiers Media S.A. doi: 10.3389/fphar.2016.00052.
[7] L. Pinzi and G. Rastelli, “Molecular docking: Shifting paradigms in drug discovery,” Sep. 01, 2019, MDPI AG. doi: 10.3390/ijms20184331.
[8] V. Salmaso and S. Moro, “Bridging molecular docking to molecular dynamics in exploring ligand-protein recognition process: An overview,” Aug. 22, 2018, Frontiers Media S.A. doi: 10.3389/fphar.2018.00923.
[9] M. Kanehisa, M. Furumichi, M. Tanabe, Y. Sato, and K. Morishima, “KEGG: New perspectives on genomes, pathways, diseases and drugs,” Nucleic Acids Res., vol. 45, no. D1, pp. D353–D361, Jan. 2017, doi: 10.1093/nar/gkw1092.
[10] A. Bateman et al., “UniProt: The universal protein knowledgebase,” Nucleic Acids Res., vol. 45, no. D1, pp. D158–D169, Jan. 2017, doi: 10.1093/nar/gkw1099.
[11] R. S. Finn et al., “Palbociclib and Letrozole in Advanced Breast Cancer,” New England Journal of Medicine, vol. 375, no. 20, pp. 1925–1936, Nov. 2016, doi: 10.1056/nejmoa1607303.
[12] K. Heikamp, F. Zuccotto, M. Kiczun, P. Ray, and I. H. Gilbert, “Exhaustive sampling of the fragment space associated to a molecule leading to the generation of conserved fragments,” Chem. Biol. Drug Des., vol. 91, no. 3, pp. 655–667, Mar. 2018, doi: 10.1111/cbdd.13129.
[13] Y. Zhou et al., “Discovery of selective butyrylcholinesterase (BChE) inhibitors through a combination of computational studies and biological evaluations,” Molecules, vol. 24, no. 23, Nov. 2019, doi: 10.3390/molecules24234217.
[14] S. A. Hollingsworth and R. O. Dror, “Molecular Dynamics Simulation for All,” Sep. 19, 2018, Cell Press. doi: 10.1016/j.neuron.2018.08.011.
[15] K. D. Apriali, E. Triana, M. I. Farhani, A. Khoirunnisa, and Y. A. Nur’aini, “STUDI PENAMBATAN MOLEKUL DAN PREDIKSI ADMET SENYAWA METABOLIT SEKUNDER TANAMAN KELOR (Moringa oleifera L.) SEBAGAI INHIBITOR BACE1 PADA PENYAKIT ALZHEIMER,” FITOFARMAKA: Jurnal Ilmiah Farmasi, vol. 12, no. 1, pp. 58–67, Jun. 2022, doi: 10.33751/jf.v12i1.4351.
[16] R. Sehrawat et al., “In silico design of novel bioactive molecules to treat breast cancer with chlorogenic acid derivatives: a computational and SAR approach,” Front. Pharmacol., vol. 14, 2023, doi: 10.3389/fphar.2023.1266833.
Downloads
Published
Issue
Section
License
Copyright (c) 2026 Mohammad Alshol, Datin An Nisa Sukmawati, Novyananda Salmasfattah, Fendy Prasetyawan, Anis Akhwan Dhafin
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
- Penulis menyimpan hak cipta dan memberikan jurnal hak penerbitan pertama naskah secara simultan dengan lisensi di bawah Creative Commons Attribution License yang mengizinkan orang lain untuk berbagi pekerjaan dengan sebuah pernyataan kepenulisan pekerjaan dan penerbitan awal di jurnal ini.
- Penulis bisa memasukkan ke dalam penyusunan kontraktual tambahan terpisah untuk distribusi non ekslusif versi kaya terbitan jurnal (contoh: mempostingnya ke repositori institusional atau menerbitkannya dalam sebuah buku), dengan pengakuan penerbitan awalnya di jurnal ini.
- Penulis diizinkan dan didorong untuk mem-posting karya mereka online (contoh: di repositori institusional atau di website mereka) sebelum dan selama proses penyerahan, karena dapat mengarahkan ke pertukaran produktif, seperti halnya sitiran yang lebih awal dan lebih hebat dari karya yang diterbitkan.
